1969年，王学圻经人介绍认识了妻子孙昌宁并确定了恋爱关系。1971年7月，两人登记结婚。婚后于1973年11月，育有一子，名王大庆。
后由于孙昌宁经常到国外出差，王学圻工作较忙，双方平时很少联络，感情逐渐淡漠，并且双方性格差异较大，经常发生争吵。
两人感情已经破裂，夫妻关系名存实亡，所以起诉要求离婚并分割夫妻两人共同财产。
2010年3月，王学圻提起离婚诉讼，要求与结婚39年的妻子离婚，北京市西城法院已正式受理此案。
2011年6月22日上午，王学圻在二度提起离婚诉讼后，最终在北京西城法院达成调解协议，双方自愿解除长达40年的婚姻关系。
2012年9月2日，博主南唐遗少在其博客曝光一组王学圻儿媳与3岁孙子的照片。王学圻的儿子王大庆已经成家立业，儿媳范霞曾经是名模特。
