2000年重返歌坛，2008年一月，潘罹患主动脉剥离，於新加坡就医。2013年2月3日上午8时57分，潘因肾脏癌引发肾衰竭，病逝於长庚林口院区，享年52岁。
其后此消息得到了潘安邦友人韩贤光的证实。韩贤光还透露：潘安邦是很虔诚的佛教徒，很希望离开能很低调的处理，以一个佛教徒离开人世间，就怕打扰大家。
2013年4月13日，澎湖县政府在「潘安邦纪念馆」（潘安邦旧居）举办潘安邦纪念音乐会。
外传潘安邦遗产有9亿新台币，潘安彦说：“太夸张了！”他只知道大哥在美国有房子、存款，但不清楚金额，也无法推估。
潘的好友、音乐人韩贤光昨说，王志翔告诉他，母子俩前晚带潘安邦的骨灰到高雄佛光山散步，昨回澎湖老家，海葬仪式由人间卫视觉念法师安排，他不知道潘家人为何没有被通知。
王昨仅海葬部分骨灰，是想把其余骨灰带回美国，与潘父安厝在西来寺。
